Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A9Q96Q91 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms