Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms