Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC4Q92889 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms