Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms