Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms