Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL22A1Q8NFW1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL22A1Q8NFW1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms