Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms