Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L3Q7Z443 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L3Q7Z443 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L3Q7Z443 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L3Q7Z443 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L3Q7Z443 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms