Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOP1Q7RTM1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms