Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCBE1Q6UXH8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms