Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSSK4Q6SA08 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSSK4Q6SA08 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms