Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDE2Q6IQ49 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms