Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms