Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MEX3CQ5U5Q3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3CQ5U5Q3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms