Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL1Q5SYE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms