Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP188Q5SRE5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms