Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDK2Q58EX2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms