Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms