Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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