Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NWD1Q149M9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NWD1Q149M9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms