Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN2CQ14957 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN2CQ14957 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms