Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSPNQ14714 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSPNQ14714 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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