Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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