Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNC3Q14003 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms