Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SHROOM2Q13796 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHROOM2Q13796 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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