Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1SQ13698 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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