Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAD4Q13485 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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