Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSLNQ13421 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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