Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMARCB1Q12824 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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