Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LRP1Q07954 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms