Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX4Q06945 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms