Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms