Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms