Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms