Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms