Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPT1P50897 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms