Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK8P49336 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms