Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP5P45974 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP5P45974 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP5P45974 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms