Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms