Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PPARGP37231 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPARGP37231 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms