Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms