Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4AP35499 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms