Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCC1P33527 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms