Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD10P28358 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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