Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms