Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XBP1P17861 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XBP1P17861 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XBP1P17861 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms