Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms