Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHGAP10645 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHGAP10645 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHGAP10645 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHGAP10645 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHGAP10645 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHGAP10645 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms