Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L8P0C7I0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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