Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLK3P07288 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLK3P07288 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms